представления эволюции конкретной вирусной популяции желательно
сначала проанализировать все возможные исходы для систем вирус-
хозяин данного типа при условии, что рекомбинация возможна. И, оценив
параметры конкретной популяции, выбрать значения, наиболее вероятные
для ее описания и изучения.
Несмотря на то что наличие положительного Дарвиновского отбора,
т.е. отбора, направленного на выживание наиболее приспособленных (на
пример, отдельных вариантов вирусов при действии иммунной системы
хозяина), усиливает разнообразие при персистенции вирусной популяции
[75], исследования динамики квазивида предсказывают появления генети
ческих вариаций даже при отсутствии иммунного отбора [24, 30,49].
Роль корреляций при возникновении нуклеотидных замен.
Более
ранними исследованиями [14] показано существование коррелированных
нуклеотидных замен в S - сегментах генотипов Тула, Пуумала, Хантаан,
Добрава/Белград, возникающих в разных частях одного и того же сегмен
та генома (табл. I).
Таблица 1
Количество корреляций, выявленных в нуклеотидной последова
тельности S-сегмента хантавирусов
Пуумала Тула
Хантаан Добрава/
Белград
Сеул
Хозяева
Myodes
glareolus
Myodes
rufocanus
Microtus
arvalis,
Microtus
arvalis ob-
scurus
Microtus
gregalis
Lagurus
lagurus
Microtus
agrestis
Pitymys
subterra-
neus
Myodes ru
focanus
Apodemus
peninsulae
Apodemus
agrarius
Niviventer
confucianus
Rattus
norvegicus
Rattus
nitidus
Apodemus
sylvaticus,
Apodemus
Flavicollis
Apodemus
Agrarius
Rattus
norvegicus
Rattus
losea
Rattus rat
tus
количест
во корре
ляций
321
34
19
26
0
Возможно, такие корреляции возникают из-за особенностей третич
ной структуры РНК S - сегмента вирусной последовательности, и играют
149