метод, впервые предложенный Д. X. Холландом в 1975 году. Использова
ние такого алгоритма позволяет найти приемлемое решение аналитически
неразрешимых проблем, его можно применять в ситуации, когда об окру
жающей среде нам известен лишь минимум информации, и в тех задачах,
где не существует общеизвестных алгоритмов решения или высока сте
пень априорной неопределенности, что мы и имеем в случае взаимодейст
вия популяций многих вирусов с иммунной системой их хозяев. О меха
низмах такого взаимодействия известно мало, на сегодняшний день есть
информация о роли отдельных сайтов (эпитопов), но не ясно общее на
правление изменений генетических последовательностей, наблюдающих
ся в процессе приспособления к организму хозяина или в случае возмож
ного переключения вируса на другого хозяина.
Эти подходы могут быть использованы для имитационного модели
рования эволюции последовательностей РНК-вирусов [47], в частности
для хантавирусов, если будет решена задача определения численного зна
чения приспособленности, поскольку оценивать приспособленность гено
типа довольно сложно, и методы такой оценки хорошо разработаны толь
ко для ситуаций, в которых взвешены различные составляющие отбора
[15]. Понятие приспособленности при моделировании эволюции вирусных
последовательностей обычно вводится с использованием понятия «квази
вид».
Концепция квазивида
С тех пор как М. Эйгсн и П. Шустер в 70-х годах ввели концепцию
квазивидов, описывающую простую эволюцию макромолекул - полинук-
леотидных (информационных) последовательностей, она стала стандарт
ной моделью также и для описания вирусной эволюции. Наибольший
вклад при этом был внесен в формирование представлений о структуре и
эволюции популяций РНК- вирусов. Неточность работы РНК - зависимой
РНК - полимеразы [22, 25] и отсутствие системы репарации РНК у виру
сов приводит к формированию квазивида - множества генетически близ
ких, но не идентичных вирусов одного генотипа с разной приспособлен
ностью, конкурирующих между собой в процессе микроэволюции в клет
ках хозяина [2, 31, 70]. Иммунная система хозяина, организм которого яв
ляется средой обитания возбудителя, направляет микроэволюцию виру
сов. При изменении среды обитания вирусов - изменении иммунной реак
ции организма-хозяина или при передаче другому хозяину - один квази
вид сменяется другим, несколько отличающимся от предыдущего (рис.1).
141