39
были включены в подгруппу носителей «молчащей» комбинации аллелей
(условное название группы связано с тем, что носительство этих аллелей по
данным литературы не ассоциировано с развитем хронического воспаления и
рака желудка кишечного типа, то есть фенотипически не проявляется).
Несмотря на несколько механистический подход, удалось сформировать две
сопоставимые между собой подгруппы носителей «провоспалительной» и
«молчащей» комбинации аллелей. Тогда как группировка по принципу
комбинации аллелей привела бы к появлению большого количества
несопоставимых между собой групп с очень малым количеством субъектов
исследования: учитывая, что в 4 из исследуемых локусов имеется SNP, а в
одном VNTR, среди которых наиболее часто встречается 2 аллеля,
минимальное число исследуемых групп при таком подходе должно было бы
составить 3
5
=243.
Сравнение подгрупп проводилось по параметрам выраженности
воспаления
в
СОЖ,
состава
воспалительного
инфильтрата,
распространенности кишечной метаплазии и преобладающих ее типов,
выраженности атрофии.
Для оценки морфологических изменений СОЖ в этих подгруппах
применялся метод «ослепления» патолога. Целью применения данного
метода являлось исключение влияния субъективных факторов на результат
гистологической оценки исследуемого материала (например, оценка в пользу
большей градации степени и стадии хронического гастрита у носителей
«провоспалительной» комбинации аллелей). Для этого весь исследуемый
материал был разделен на два изолированных потока: материалу для
гистологического и ИГХ исследования присваивали собственный
порядковый номер (начиная с №01); материал для генетического
исследования регистрировали в журнале ПЦР-лаборатории кафедры, в
результате чего он получал индивидуальный номер в соответствии со
сквозной нумерацией, принятой в лаборатории (при этом материал