Упрощенная HTML-версия
46
покрывали 25 мкл минерального масла, после чего под слой масла добавляли 5
мкл образца ДНК. ПЦР проводили на амплификаторе "Терцик" ("ДНК-
Технология", г. Москва) по следующей программе (таблица 3):
Таблица 3
Программа амплификации
T, С
94
93
93
64
72
72
10
Время
Pause
1 мин 10 сек 10 сек 20 сек 1 мин
Storage
Количество
циклов
1
35
1
Анализ рестрикционных смесей проводили с помощью электрофореза в
3%-м агарозном геле с бромистым этидием. Результаты документировали с
помощью видеосистемы для регистрации гелей «DNA Analyzer» (НПФ
«Литех», Россия). Частоты аллелей и генотипов полиморфных локусов,
соответствие распределения частот генотипов равновесию Харди-Вайберга (
²)
определяли по стандартным формулам. Сила ассоциаций оценивалась в
значениях показателя отношения шансов (odds ration, OR). Вычисление OR и
95% доверительного интервала (CI) проводилось при помощи он-лайн
калькулятора, доступного по ссылке: http://www.hutchon.net/ConfidOR.htm.
2.2.12. Прогнозирование рецидивирующего и перемежающегося течения
первичного СП
При построении прогностических моделей для бинарных зависимых
переменных использовался метод логистической регрессии. Для определения
ценности прогностических признаков (моделей) в отношении зависимой
переменной определялись их чувствительность и специфичность по
стандартной методике, положительная, негативная прогностическая ценность и
точность Для непрерывных или интервальных рядов значений признака
строились характеристические кривые (ROC-кривые) чувствительность – 1-
специфичность с расчетом коэффициента – площадь под кривой (ППК) и его
95% доверительного интервала. Прогностическая точность признаков считалась