Но круто меняет судьбу Николая Николаевича 1938 год: его
призывают в Красную Армию, где он работает врачом полка, с 1939-
го – старшим врачом полка.
Первый день войны застает Николая Николаевича в должности
начальника санитарной службы 178 дивизии, расквартированной в
Омске. Вскоре дивизия выступила на фронт, приняв боевое крещение
под Смоленском. Николай Николаевич был в то время начальником
противоэпидемической службы дивизии.
1942 год. Это было самое тяжелое и трагическое время для всей
страны: тяжелейшие оборонительные бои на Днепре, Западной Двине,
на Волге, подо Ржевом. Николай Николаевич – начальник
санитарной службы 178 дивизии. «…За умелую организацию
медицинской помощи раненым» военврач Н.Н. Гагарин получает свой
первый боевой орден – орден Красной Звезды.
1943 год. Николай Николаевич – начальник противоэпидемического
санотдела 22-й Отдельной армии, в составе которой прошел по всем
фронтам Отечественной войны до самой Победы. За умелую
организацию противоэпидемических мероприятий в армейских
подразделениях Н.Н. Гагарин в 1944 году вновь награжден, на этот
раз – орденом Отечественной войны.
1945 год. Н.Н. Гагарин – начальник эпидемического отдела округа.
После войны – служба в Таврическом военном округе, а с
1946-го по 1957-й – в Омском военном медицинском училище
им. Щорса начальником инфекционно-эпидемиологического цикла.
В 1957 году полковник медслужбы Н.Н. Гагарин увольняется из
рядов Советской Армии в запас. В запас, но не на отдых.
Как опытнейшего эпидемиолога, санитарного врача, прекрасного
наставника руководство медицинского института пригласило
Н.Н. Гагарина на преподавательскую работу в должности ассистента
кафедры эпидемиологии, где он трудился до ухода на пенсию.
На кафедре Николай Николаевич курировал разделы военной
эпидемиологии и дезинфектологии. Избранные лекции по военной
эпидемиологии он начал читать студентам с 1948 года, когда еще
служил в военном училище. За годы работы на кафедре впервые им
было составлено большое количество методических пособий и