219
923127341016260120
Лабораторные1062551018894157228298368430491561631706800862
исследования1960551018899161223293355427497563625700775839
выполнялись2834551018891185260330400475539609684746810
на36805510188100162
базе3876551018896159214276
Академического418855101881261942563273894785536236857478158859431013
центра52355510188100162237298368430
лабораторной708794018869132203273343405466536606681751826
диагностики1569794018892167230287362432494555630698773
ФГБОУ23777940188132213293394493
ВО29067940188114215
«Омский3156794018892193281344411486561
государственный37527940188791492112813524154845476086747368118869801055
медицинский48427940188110172243318393468543605673748822
университет»7081034018870144219285348418480554616678739809
Минздрава155210340188158233308363435505567633695
РФ228210340188112222
(главный25391034018881138208270336411505580
врач315410340188100170232303
–349210340188104
д.м.н.,363110340188105140229264339374409
доцент407510340188105175250312387448
Индутный455810340188135210282352413488582657
Антон525010340188135210271341416
Васильевич)7081276018893155217292362426488554629700746
и14891276018894
Центральной161912760188120182257318388450520584659729804
научно-исследовательской245812760188941562262973724424885636256877578198919601027108911501212128213461408147615461621
лаборатории41141276018889152223293363425486556626701776
ФГБОУ494512760188110191271372471
ВО545212760188112213
«Омский7081519018870171259322389464539
государственный128215190188207277340409481543613675736802864939101411081183
медицинский250015190188238301372447521596671733801876951
университет»348615190188220295369436498568630705766828889959
Минздрава448015190188274349424479551621683749811
РФ532615190188227338
(заведующий7081759018846102164230292363433538645721796
–15391759018869
к.м.н.,16441759018867103191226301336371
доцент20501759018871141216278353415
Новиков250017590188100171237312380450516
Дмитрий30511759018895184259320390465540
Георгиевич).36261759018881143213283340415478544619689736771
Методы106220020187124186295365435532
инструментальной162520020187771552173263964585546166948038739451009108611561234
диагностики28902002018769147217269347417479588666737814
на37352002018777148
втором39152002018762170241311381476
этапе44262002018753162232310372
исследования48302002018777140202274336405475538608685763835
Объем106222430188101172244307395
инструментальных1486224301887414921127234241250156363869976183189597010641134
методов26492243018888150211281352422488
исследования31662243018875137199269331402472538600675750815
определялся40102243018870145215277348410480545614677741
в47792243018866
соответствии48742243018862132202263329391452514576642717791
с7082483018862
клиническими8052483018868137212287362433495557625700788863
рекомендациями170424830188691311992693584204955666287037788439311006
Российской27452483018878148210272347422484552622697
гастроэнтерологической347724830188571191822433133834435185796417117818519219791053112411861248131613861461
ассоциации49732483018862124186256331406468543618693
и7082726018874
Ассоциации81827260188131193255325400475537612687762
колопроктологов161527260188981682383083834535235916527227928629209901056
России270627260188108178240302377452
по319327260188105175
диагностике340427260188101176238295370440502564638706769
и420827260188105
лечению434827260188100162232295369444549
СРК493227260188124202295
[10]52622726018876146216263
и556027260188105
включал7082966018866134204308379441511
ультразвуковое14482966018870139203265335397452518588656726792862924
исследование26022966018874137199268331402472538600675750812
органов36442966018870140197259334404470
брюшной43442966018871141245353428498573
полости,51472966018874144214284347408483518
эзофагогастродуоденоскопию,7083208018860115185276338395465523585647708778848920990106011311193126813381400146815381613168817921828
илеоколоноскопию257132080188152222284354422492562632706776839907977105211271231
с383732080188139
биопсией401232080188148223293368430505567642
терминального468932080188138200270359434509571641705780850907977
отдела7083451018870131202264334396
подвздошной113934510188124194265332387458528636711781856
кишки203034510188117192299368443
и250834510188124
толстой266734510188110180250312373443518
кишки322034510188117192300368443
для369834510188121190255
исключения398834510188124186254324428499561636711775
органических479834510188119189247309384459529591653721796866
заболеваний.7083691018855117188258328390456519593668743779
Секвенирование10623934018793155226289351428506576646709779856934997
биобанка20943934018793171241311381459530600
образцов27293934018794164234304358436506569
микробиоты333339340187119197268338408478556626734832
кишечника42003934018795173289351425503580651721
на495739340187102172
втором51643934018786195265335405501
этапе7084174018758166237314377
исследования11204174018777140202274336405475538608686764836
Секвенирование10624415018893155223289352426501571641707769844919981
образцов20784415018869141211273328403473539
кала,26524415018867129199261297
собранных29844415018861131202272334409484578648
у36664415018870
пациентов37704415018875137212287349424485555621
с44264415018862
СРК45224415018893171264
(4048214415018846116186
человек)50414415018870132202272338401469515
и55914415018874
практически7084658018874145207275336411481543605673748
здоровых14914658018876147217287357424517588
лиц21144658018890165240
контрольной23894658018889159234295365435505568643713788
группы32134658018877147217292367461
(1037104658018867137207
человек)39524658018891153223293359421489536
проводилось45234658018895165235301371443518587657720783
ООО534246580188121222323
«Кномикс»7084898018870163238308396471539602672
(г.14154898018846104139
Москва).158948980188124194256324390452499534
Выделение10625140018893187258320390453527602664
ДНК176251400188124225318
из211651400188103158
образцов23095140018899170240303358433503569
кала29135140018897159229291
проводилось323951400188104174244310380451526596666728792
с40665140018891
использованием419251400188103166241311380444500569636698773847910998
набора522651400188103165236306376439
реагентов7085383018870132194251313388449519586
«AllPrep132953830188103204244283360407469539
PowerFecal190353830188112182283345392470532594656695
PRO»263353830188112205306376
(Qiagen,30455383018880181220282352414484519
Германия),359953830188115177247336398473548612659694
согласно43285383018896166223293355418492562
инструкции492653830188108183246307377447515590665740
производителя.7085623018874145215289345411481552627688750820885920
Амплификацию1663562301881742633384074825736487167788539281032
вариабельного273156230188139201271346408480542611675750820878948
участка371456230188143214276338399467529
V4427856230188175245
гена455856230188131193268330
16S492356230188144213291
рРНК524956230188144222322416
проводили7085865018874145215281351422497567642
с13855865018866
использованием14865865018879141216286356420475545611673748823885974
следующей24955865018866136198269339444552614689
системы32195865018866141203264327415509
праймеров:37635865018879149211286375437507577643682
модификация44845865018888159230305395470538600675750815
51553345865018874144214
F55835865018882
(5′‐GTGBCAGCMGCCGCGGTAA‐3′)7086105018846116147194294380481574668769870963108811891282137614771570167117721858195920602107217622072254
и33616105018874
Pro-mod-80538356105018877124194241349420490536606676746
R49806105018893
(5′-54726105018846116147194
GACTACNVGGGTMTCTAATCC‐3′).708634701881012022953814825756767778789791080116612901376146915551656175718431936202920762146217722232258
Второй300163470188112173243313383458
раунд34946347018888150220295366
амплификации38956347018880168243313388479554622684759834909
проводился48396347018892162232299369440515585647711
с55856347018880
использованием7086590018874137212282351415471541607669744819881969
стандартных17136590018888149211286357419489550625719789
индексов253765900188101176247309377439509576
Illumina31486590018872111150220329368438500
с36836590018888
адаптерами.38066590018888159221296358420490552640715750
Оба459165900188127198261
раунда48876590018895158228303374436
ПЦР535865900188127228306
проводились7086830018874145215281351422497567642704768
с15116830018899
использованием1646683001881121742493193894535085786447067818569181007
ПЦР268868300188138240318
буфера304168300188109178269331401464
производства354068300188112182252327383449519590652713779841
Евроген441668300188123190260330387449524
(Россия)49756830018885162232295357431496543
и555368300188112
амплификатора7087072018862150225295370461536604666727797867929
CFX-96167370720188132210311358428498
(BioRad22067072018887180219289382445515
Laboratories,275670720188125187257327374436475545592630692747782
США).357370720188134274376423458
Очистку406670720188141211286348409477547
ПЦР464970720188140242320
продуктов500470720188115185255326396464525595661
проводили7087315018874145215281351422497567642
с13857315018877
помощью14977315018891161249319427491595
набора21287315018890152223293363425
для25887315018887157221
выделения28447315018881175247309379441516591655
ДНК353473150188111212305
реакционных38757315018885147209277352427497572647741811
смесей47217315018878166228291353427
Cleanup518373150188109148210272342412482
Mini70875550188124163233272
(Евроген,10157555018851136203272342400462537572
Россия).16227555018882152214276351416462497
Концентрацию21597555018893163238313375450511581643718793897
ДНК30967555018895197290
определяли34217555018875149219282353415485549619694
с41507555018866
помощью42517555018880150238308416480584
флуориметра48757555018890160230300370445534596657727789