234
193127341016260120
Анализ10625510188101176238308383438
данных15355510188122184259334428498
секвенирования206855101881121742423083714465205916617277898649391003
микробиома31065510188139214282352422494568638727789
был39305510188122216286
проведен42515510188125195265331394465527602
с48885510188113
помощью50365510188125195283354461525630
платформы708794018874144207268358428499587681
Knomics-Biota142479401882683384085175566186737198138529229611023
(https://biota.knomics.ru/).24827940188213283322361431485525563602672711781820882917987105711271235127513371391142614731543158216281663
Первичные41807940188268330400467541612687781843
данные50587940188238301375450544607
секвенирования7081034018862124192258320395470540610676739813888953
(риды)16961034018868138213284378425
предобработаны215610340188961662283003704415115736447147768389121007
с31981034018883
использованием33161034018897159234304374438493563629691766841904992
программного43431034018896167237294364426515603678748806876
пакета52541034018896159227289350412
QIIME2.70812760188101147194318404474509
Оценка125212760188117192254329397459
совместной17461276018878148214303365427488563633708
встречаемости24891276018882144205275338408470532620691753814889
таксонов34131276018877139207269339414484550
в39981276018882
образцах41151276018886157227290345420482552
проводилась47021276018890160230297367438513583645707771
до55081276018887157
уровня7081519018870140210276351415
рода,11581519018899169241303338
сосуществования1531151901889116122329340146352558665372378985192610011065
микробных263115190188118193261331401472547641711
родов33771519018899169240310376
–37891519018899
на392315190188104167
основе41251519018899161236306372434
корреляционного4595151901889716723730736943950357865372379887394310001070
анализа7081759018862137199269344399461
их12011759018875145
относительной13781759018869131206276338413474536606670745815890
численности23001759018870145207277339414489559621682757
с30921759018859
использованием31831759018875137212282352416471541607669744819881970
программы41851759018874144215272342404493581675
SPIEC-EASI.48921759018878156203288381427512613691738773
Для7082001018895165229
каждого9712001018867130226297367425495
образца14992001018870141211273328403465
вычислялось19992001018864158229304366436500570640702766
медианное27982001018888151222297359434509579641
расстояние34722001018870132194256317387452526601664
до41692001018871141
ближайшей43432001018871141215312374450557620694
половины50712001018874144214284350425500594
образцов.7082243018870141211273328403473539574
Распределение1317224301881952573193944645265976607297928669411003
образцов235522430188187259329391446521591657
было304722430188188282352422
аппроксимировано3504224301881802543293994695375996747638389089781044110611811251
нормальным479022430188192262332420483552616691785874
распределением,70824830188701321942693394014725346046667418168789661002
образцы174524830188202273343405461535629
с241024830188194
расстоянием263924830188201264326388449519584658733796884
выше355924830188197291399461
99%-перцентиля40562483018820127138843450957164171677885391498910591124
этого521524830188191253323380450
распределения7082726018870132194269339401472534604666741816880
считались16232726018862133207269331401475538601
выбросами.22602726018865159231301371433495583658694
Для10622966018895165229
оценки13282966018878153215290358433
различий17952966018878141196266341411486561
между24002966018888150247318388
образцами28242966018879150220282337412474563638
кишечной34962966018876151259321391466536611
микробиоты41512966018888163231301371443517587649742
пациентов49302966018883145220295357432493563629
с55932966018871
СРК7083208018893171264
и100732080188119
здоровых11613208018899170240310380446540610
лиц180632080188113188263
по210432080188119189
группам232832080188101171241315390452541
применялся290432080188119189263352414489554623686750
пермутационный3689320801881191812513394094715336086827528279029961071
многомерный479532080188132207277335405493556626700794869
дисперсионный7083451018871146208283345415477552622697772866941
анализ16853451018873148211280355411
(PERMANOVA),213134510188581362223154395406427438449459921027
метрика319334510188100163224294369437499
бета-разнообразия:37273451018883145207269314384446501576646716787857919975104911141153
взвешенный49153451018877133199261368431506581674749
UniFrac.70836910188101171210287334396458494
Результат123736910188139202257327397461522584645
включал191736910188128196266370441503573
в252536910188128
себя268836910188125187258322
общее304536910188132203311373436
количество351636910188130199269344415477539600666736
выборок,428736910188128222293363433503571607
количество492936910188129199269344415477539600666736
перестановок7083933018874137207269331392454529599665735803
PERMANOVA,154639330188119204298422523624725826928963
p-значение254439330188110157213287350420482557632694
для327339330188112182246
нулевой355539330188115185255317383453528
гипотезы41183933018899173248318380442497591
об474439330188111182
отсутствии496139330188111172234304365427489555630704
различий7084173018870132187257332402477552
между12874173018888151247319389
группами,17034173018857127197272347409498573608
а23384173018862
также24274173018861123191288350
информацию28054173018874149240310380468531605680785
о36174173018870
равенстве37144173018870132198260335397459525587
групповых43284173018857127197272347417483577647
дисперсий,50034173018871146208282345415477551626662
полученную7084415018874145214284355417492567637741
с148544150188151
помощью167144150188164235323393501565669
метода237544150188178241302372443505
PERMDISP291544150188167253346470571618696774
при372444150188164234309
одинаковом406944150188159230305380442510580646716805
количестве490944150188157227297372442505567628694756
перестановок.7084658018874137207269331392454529599665735803838
Таксономический106248980188851472152773474224925816567267888509189931068
состав21654898018873143206267329395
образцов25954898018881152222284339414484550
кишечной31804898018879154262324394469539614
микробиоты383048980188100175243313383454529599660754
различных46194898018881143198268343413488582652
групп53054898018869139209283358
пациентов7085140018874137212286349423485555621
с136451400188107
СРК150651400188137215308
и185051400188119
здоровых200451400188100171241311381447541611
лиц265151400188114189264
оценивался295051400188114189251326401467530599662726
по371151400188119189
сумме393551400188107177265354416
рангов438651400188115177252309379445
Уилкоксона.486751400188143218288356426494556626701763798
Множественная70853830188124199269366428490551617680754829892956
корректировка169953830188135205275345408476537612682752818886948
тестирования268253830188129191253314389459529595658732807872
выполнялась358953830188133227302372442517582651714776840
с446453830188129
использованием4628538301881422052803504204835396096757378128879491038
процедуры7085623018874145215289352423493563657
Бенджамини-Хохберга.140056230188801432172893854475366116867618089089791049112011821252130913721407
Для10625865018895165229
количественной132858650188100170240315385447510571637699774849919994
оценки235658650188103177240314382457
вклада28495865018898166236298369432
каждого331658650188100163259330400458528
выявленного38805865018899193257324393456530605675733803
признака471858650188107177252308383445513575
(S)53285865018879157204
в55665865018899
формирование7086105018890160230319394464534600662737812874
того16176105018873143200270
или19226105018887157231
иного21896105018886161231288358
фенотипа258261050188103165240310371446521583
СРК320061050188105183276
(D)35116105018859160207
использовалась37536105018886149223293363427482552619681751813875939
теорема47276105018872135205275337425487
Байеса52506105018891154228291353415
[15],7086347018846116186233268
которая101163470188115185246316386448513
предполагает,155963470188121191254325400470540602659722784845880
что247463470188117178248
конечная275763470188115185259322392467529594
вероятность338663470188113175245315379440515585647709772
гипотезы419463470188104178253324385447502596
или482563470188122192267
наличия512763470188121184254328399474538
данного7086590018871133208283353410480
фенотипа12206590018890153228298359434509571
СРК18236590018893171264
P(D|S)21186590018878125225254331378
при25286590018874144219
конкретном27796590018868138213281351413474549619708
наборе35196590018874136208278348410
признаков39616590018874144219274349411479549615
пропорциональна460865900188751452152903604305055796497247868569209951057
ее7086830018862124
исходной86768300188108170240310382456527601
вероятности15046830018899161231301366427502572634695770
P(D),230968300188111158258305340
помноженной268468300188108178267342412508571646720790865
на358568300188108170
ее37906830018895158
правдоподобие398368300188108178240306377447522592663733805880942
P(S|D),496068300188111158235263364411446
где54416830018891162224
P(S|D)7087072018877124202230331378
формально112170720188140211281369431501565640710
есть186670720188112175236300
вероятность220170720188116178248318383444519589651712776
того,301270720188112182239309344
что339170720188121182252
конкретные367870720188118188263331401463524599693756
признаки446970720188125195270325400462530605
S510970720188127
будут527170720188122192263333394
обнаружены7087315018870141216278348418514577651745
у148973150188113
пациента,163773150188118181255330392467528591626
если229873150188105167237312
у264573150188113
него279473150188118180237307
будет313673150188115185256318380
диагностирован355173150188114189251309384454516577652722792858920995
данный458173150188115177252326420495
фенотип511273150188133196271341402477552
заболевания7087555018855117188258328390456519593668733
D.147675550188121157
По166875550188121191
сути,18947555018883153214289324
P(D|S)22537555018898145246274352399
выражает26877555018886180251313409472534595
существенность33177555018883153261323385447513575650725795857918982
вклада43347555018887155225287358420
определенных47907555018890165235297368429499561636711805875