231
603129340016360120
часов851551018970132194264330
и1229551018975
байесовская1354551018971133208270333403469531599661726
модель2128551018988158230292362425
горизонта2602551018957127198272328398473534597
были3247551018971165235310
выбраны3605551018966160231301364438533
при4187551018975145219
анализе4455551018962137199269343399461
данных4965551018971133208283377447
в5461551018966
программе851792018975145215272342404493581643
Tracer15297920189200247309371434480
v1.7.120447920189185255290360395465
[235].25457920189161231301371418452
Две3146792018995161223
независимые3520792018975137192254320395458532621715778
цепочкиMCMC444779201897513721228235342149649777920189239332457550
выполнялись8511034018966160235305375450514584659721785
с17031034018962
шагом500183110340189108170228298387225310340189101171241
×253010340189110
106267510340189101171242
с29831034018962
регистрацией31121034018970132189264326387457520594669731806
каждые39851034018968130227298392455
2500447410340189102172242312
поколений48531034018975145213283353415490565639
,54921034018935
исключая8511275018975137205275379450512576
первые15191275018975137207273367429
25%198312750189127197313
для23891275018971141205
каждого26861275018968130227298368425495
запуска32721275018955117192262324392454
.37271275018935
Конвергенция38541275018993163238304366436494556631706781845
цепей47901275018975137212274348
была52311275018971165235297
оценена8511517018970145207282344419481
на14061517018975137
основе16181517018970132207278344406
эффективного20981517018960151242304372433508574649719777847
размера30191517018970132187276338408470
выборки35631517018966160232302372440515
(ESS)41141517018986171249327374
в45621517018966
Tracer466315170189125171234296358405
v1.7.1.510315170189109179214284320390425
Оценки85117580189101176238312380455
параметров13501758018975137207269358420481552622688
с20811758018962
ESS21781758018994172250
более24721758018971141211273336
20028421758018979149219
были31061758018971165235310
принятыкак3460175801897514522029435942051440181758018968130198
надежные42591758018975137208270367442536598
.48581758018935
Деревья49371758018995157227290356419484
с54651758018962
максимальной8512000018988151219281356445507577641716786860
достоверностью19312000018971141203264334400463532607677739801864969
(MCC)31202000018947171264358404
суммировались37452000018962132221309384454524590652722797859923
,46672000018935
используя49232000018975137212282351415471540605
TreeAnnotator8512241018985132194256357427497567606668707777824
v1.10.1.17102241018991161196266336371441476
На224322410189101163
заключительной24622241018955118185255360430505567629699763838908983
фазе35022241018991153208270
исследования38292241018975137199269331402472539601676751815
деревьяMCC47002241018971133203265332395460521622410189124218311
быливизуализированывFigTree85124830189711652353101196248301896614119626632839847352860367374380987294610412272248301896623722483018978117187272319381443
v1.4.0и2850248301897014017524528035032362483018975
/33462483018939
илив3419248301897514521936742483018966
инструменте37752483018975150212273343414502564639700763
iTOL45722483018939124225311
[209].49182483018947117187256303338
2.3.3.20892723019470105175210280315
Филогеографический243927230194120201279349413475545609686756853934101310751137121812991379
анализ38532723019470150220299379435
Распространение120529660189781402022773474174795406106727478098849591021
ВИЧ22762966018993194285
на26102966018975138
протяжении27972966018975145215276340437499574649724
всей35702966018966128190264
филогенетической3884296601899116523630636342650056362469976983189396110311106
истории50392966018975137198268338413488
было8513207018971165235305
вычислено13883207018966160230305367437499574643
с22633207018962
использованием25573207018975137212282352415471541607669744818881969
байесовского37573207018971133208271333403469531599669727797
дискретного47863207018971146208275345407469544614671741
филогеографического851344901899116623530536342549555362368577585092198310451113118312411311
подхода23143449018975145216286356428490
и29563449018975
процедуры31843449018975145215290352424494564658
выбора39943449018966160231301371434
переменных45803449018975137207269357419494569663733
с54663449018962
байесовским8513690018971133208270332402468531598674762
стохастическим16713690018962123193263325388449524594656719787862950
поиском26803690018975145220282350420508
(BSSVS).32233690018970163241319420498544579
Все38613690018993155218
возможные41373690018966136191280350447522616678
обратимые48743690018970141211273335409498592654
перемещения8513932018975137207269358420528590665740804
между17493932018988151247319389
локациями22333932018970140207270344419483572646
считались29743932018962133207269331401476538602
одинаково36703932018970142217292354422492558628
вероятны43923932018966128198268332394468562
и50493932018975
были52183932018971165235310
перенесены8514173018975137207269344406468530605699
в17104173018966
BEAST181141730189218303404482567
v1.8.2.241341730189194265301370405475510
Набор308341730189101163234304374
данных36174173018971133208283377447
для42244173018971141205
этого45884173018960121191249319
анализа50674173018962137199269343399461
оптимизировался85144140189701452062813694444995746447147808429129741038
посредством21754414018975145207277339410472534600670758
исключения32184414018975137205275379450512586661726
некоторого42294414018975137205275336406476546603673
числа51884414018970145207277340
последовательностей851465601897514520727733941048054660866973180186594010091072113311951271
генома21944656018957119194264353415
РНК26814656018978179272
ВИЧ30254656018993195286
,33114656018935
выделенных34184656018966160231294364426501576670740
от42304656018970131
пациентов44334656018975137212287349424485555622
города51274656018957127198268339402
Красноярска8514897018993163225287362432496566629697759
,16104897018935
поскольку17564897018975145207275345415479547617
их24834897018975145
количество27404897018968138208283353415477539605675
значительно35264897018955130192262338399461530594669739
превышало43764897018975145207273367475537607677
объем51654897018970141213275364
данных8515139018971133208283377447
из13825139018975130
других15955139018971141212269344414
территорий20925139018961123193263338399469539614689
.27815139018935
Для28995139018995165229
данного32125139018971133208283353411481
анализа37765139018962137199269343399461
было43215139018971165235305
окончательно47105139018970138208283354416477539609673748818
отобрано8515380018970131201273343405480550
18914365380018992162232
последовательностей1726538001897514520727733941048054660866973180186493910101072113311951270
.29965380018935
ЦепочкиMCMC308953800189101163238308378446521366853800189124218342436
выполнялись41625380018966160235306376450515585660722785
за50055380018955117
40051575380018992163233
×542653800189101
1068515622018970140210
шагов112456220189108170227297363
с15495622018962
регистрацией16735622018970132190265327388458520595670732807
каждые25435622018968130227298392455
250030335622018997168238308
поколений34035622018975145213283353415490565639
,40435622018935
исключая41405622018975137205275379450512576
первые47795622018975137208274368430
25%52445622018997168284
поколений8515863018975145213283353415490565639
для15435863018971141205
каждого18025863018968130227298369426496
запуска23515863018955117192262324391453
.28045863018935
ДеревьяMCC28925863018995158227290356420484343058630189124218311
были37945863018971165235310
обобщены41575863018970141211282390452527621
с48325863018962
помощью49475863018975145233303411475580
TreeAnnotator8516105018985132194256357427497567606669708778824
v1.10.1171061050189156226261331401436506
и23386105018975
визуализированы253461050189661411962663283984735286036737428088719451039
с36956105018962
помощьюFigTree38786105018975145233303411475580449261050189164203273358405467529
v1.4.2.505661050189156226261331366436471
Маршруты85163460189124186257364434504566660
миграции15706346018988163221291353428503578
и22076346018975
пространственные2342634601897514521527733840847054560766973579787294710411103
проекции35046346018975145215277345420494569
были41336346018971165235310
суммированы45026346018962132221309384455525591653728822
по53846346018975144
траекториям8516588018961131193255323384454524599663752
с16726588018962
использованием18036588018975137212282352415471541607669744819881969
программного28426588018975145215272343405493582657727785855
обеспечения37666588018970141203265340402472535609685749
SPREAD455065880189112190283368469570
[259].51556588018981151221291337372
Статистическая8516829018993154216278352415476551621683746814876940
поддержка18746829018975145216287349419516584646
миграционных26036829018988163221291353428503573648723817887
маршрутов35746829018988151221328398468530599666
была43226829018971165235297
определена47036829018970145214277348410480542617680
с54666829018962
помощью8517071018975145233303411475579
байесовского15187071018971133208270333402469531599669726796
фактора24027071018991153221282352422485
(BF);29217071018999193271317357
поддержка33667071018975145216287349419516584646
BF404670710189146224
более43587071018971141211273335
3472870710189122
считалась49397071018962133207269331401463525589
статистическизначимой851731201896212318524632138344451959065271478285717437312018955130192263338427497572
.23157312018935